龟头流脓尿道疼痛，多考虑可能为急性尿道炎所引起，临床上主要分为淋球菌性尿道炎、非淋球菌性尿道炎两种类型，都可导致患者出现龟头流脓、尿道疼痛感。
淋球菌性尿道炎主要是由于受到淋球菌感染所引起，尿道口部位可出现较多的黄色脓液，而且还可伴有尿道疼痛以及尿急、尿频等表现。
非淋球菌性尿道炎通常是由于受到病毒、滴虫、霉菌以及衣原体或支原体等病原菌感染所引起，该类型的尿道炎龟头所流出的脓液相对稀薄，而且尿急、尿频等尿路刺激征相对较轻。