阵发性房颤患者可口服β受体阻滞剂及洋地黄制剂来控制其心室率，另外可口服其它转复心律的药物，将异常起搏点引起的心律转复为窦性心律。
阵发性房颤患者的治疗除对患者心室率的控制以及转复心律外，还需要对导致患者阵发性房颤的诱因以及病因进行相关的治疗。
在临床上绝大多数阵发性房颤患者都伴有程度不同的器质性的心脏病，比如冠状动脉硬化性心脏病、高血压性心脏病以及风湿性心脏瓣膜病，这种情况治疗原发病的同时，同时予以控制房颤症状一般效果良好。