海绵肾双肾结石可行体外冲击波碎石、输尿管镜碎石治疗。
海绵肾形成的双肾结石，一般数量比较多，分布的位置较广泛，一次治疗往往不能促进结石排出，需要多次治疗。可做体外冲击波碎石治疗，将结石击碎后，服用排石药物，通过大量喝水，多排尿液，多做运动，促进结石排出。通常需要做多次体外冲击波碎石手术，才能将结石清除。
也可选择做输尿管镜碎石手术治疗，通过软镜进入输尿管，再进到肾脏内，将肾脏内存在的较大结石进行清理。如果较小的藏在肾盏内的小结石，可不用特殊处理，患者需要多饮水，多排尿。