生殖器水肿多考虑可能是由于机械性刺激所引起，比如过度手淫、频繁性生活或者受到外力猛烈撞击等，都可造成生殖器水肿，还可能会伴有明显的疼痛症状。
也可能为感染因素所引起，常见于睾丸炎、附睾炎、包皮龟头炎等疾病，由于炎症的刺激作用，可导致生殖器水肿。同时还可伴有分泌物明显增多、阴茎局部皮肤黏膜溃烂、渗出、生殖器痒痛等表现。
此外，还可能为全身性的病变引起继发性的生殖器水肿，常见于低蛋白血症，可导致病人出现生殖器水肿，还可伴有面部以及四肢水肿等表现。