肺部真菌感染和病毒感染的区别：
首先，感染的致病原是不同的。真菌感染可以由曲霉菌、念珠菌、隐球菌、毛霉菌等真菌感染引起，而病毒的种类也有很多。故两者属于不同种类的感染致病原所致的疾病。
其次，影像学检查的区别，在胸部CT检查时肺部真菌感染其表现形态不一，可以为结节、肿块、实变影，有时还有空洞影、新月征、晕征等改变。而肺部病毒导致的改变一般多呈现渗出、实变影和两肺弥漫性间质性改变，一般无空洞、肿块等改变。
治疗上的区别，肺部真菌感染治疗时间长，多需要4~6周以上时间，而且患者也需要使用抗真菌的药物。肺部病毒感染治疗需要试用一些抗病毒药物，其治疗时间明显短很多，患者同时需要加强对症支持处理。