幼稚子宫是先天性的，主要是女性子宫段副中肾管发育，及融合异常引起的先天性子宫发育不良所引起，主要与染色体、性腺或生殖器发育过程异常有关。
正常的女性生殖器发育过程很复杂，胚胎在孕7周时，生殖器官就在慢慢开始发育，到孕8周时双侧副中肾管迁移至中肾管内侧并且在中线处汇合。如果这个过程出现异常，幼稚子宫就可能出现。
幼稚子宫是有着宫腔和内膜，但子宫体积小于正常大小的情况，而这种情况下的大部分女性的卵巢发育正常，所以也会有月经的来潮。但因为幼稚子宫的内膜面积小，所以产生的月经稀少，而且还会有初潮延迟，伴随痛经的症状。