怀孕初期是可以吃益生菌的，益生菌不会对妊娠组织的发育造成明显影响。
益生菌的主要成分主要是肠道内的有益菌群，或者是有益于消化且对人体无害的菌群，这些益生菌的服用，可以促进肠道的蠕动，对于缓解孕期因孕激素水平增高而导致的消化功能减弱具有一定的治疗效果。所以，益生菌可以在整个怀孕期间进行食用。
在怀孕期间，如果要接触饮食以外的药物、保健品，建议通过专科医师的指导，避免对妊娠组织的发育造成明显影响。怀孕期间并不是绝对不能使用药物，但是药物对胎儿的安全性需要进行评估。