肛周脓肿的治疗方法主要有以下一些：
第一，用药治疗，主要是抗生素抗炎治疗。因为肛周脓肿属于肛管直肠周围化脓感染性的疾病，需要使用广谱抗生素控制局部的感染，严重的需要联合使用抗生素增加治疗效果。也可以配合外用消肿止痛的药物缓解局部症状。
第二，非手术治疗方法。对于一些没有手术条件或者身体条件不允许手术的患者，可以采取脓腔穿刺抽脓减压，缓解局部症状。
第三，手术治疗，是肛周脓肿最主要的治疗方法。肛周脓肿患者应首选手术治疗，将脓腔切开引流，绝大多数的肛周脓肿也只有通过手术才能治愈。