睡醒之后心跳加速，可能是因为心脏器质性疾病造成。
临床医学上比较多见的主要包括冠心病、心肌炎症或心包炎等，也可能是由于不稳定心绞痛或高血压性心脏疾病、心脏瓣膜病等造成的心律失常，一般会在睡醒后，会有心跳加速的症状。也有的人在身体中毒或体内酸碱失衡代谢紊乱时，也容易在睡醒之后有心跳加速的现象。也不排除是由于得了内分泌系统疾病，比如甲亢、肾上腺皮质功能亢进等，也容易导致这种症状。
除此之外，患有心脏神经官能症的人，比如出现植物神经功能紊乱时，也会导致睡醒后心跳加速。