以下这几类人必须做羊水穿刺，比如如果唐氏筛查甚至无创DNA检查提示胎儿存在高风险，或者四维彩超大排畸筛查提示胎儿严重畸形者，是必须做羊水穿刺的，以排除胎儿存在染色体畸形的风险，以降低新生儿出生缺陷的几率。
另外年龄大于等于35周岁的孕妇建议羊水穿刺，超过40岁的高龄孕妇必须做羊水穿刺，还有既往有过胎儿严重畸形的孕妇以及孕期曾经接触过可能会导致胎儿严重畸形的物质。
或者夫妻双方有先天性染色体异常或者有家族性遗传病史的孕妇，都必须做羊水穿刺，以尽早发现胎儿畸形，并给予对应的处理，以降低风险。