结膜炎多年不好可以使用抗炎、抗生素的药物治疗。再针对结膜炎发生的病因进行治疗，若患者是感染导致的结膜炎，可以给予抗感染治疗。
并且要去除引起结膜炎的病因，比如经常熬夜、抽烟、喝酒，长期吃辛辣、刺激、油腻的食物，长期长时间过度用眼，都可以导致结膜炎的发生。若患者经常眼部化妆或者不注意用眼卫生，也会导致长期的结膜炎。
药物治疗只能短期使用，长期用药会对眼睛造成损害，因此，患者要养成良好的用眼习惯。