旋转肌腱炎会引起肌肉萎缩，其原因是：
第一，旋转肌腱炎本身会造成疼痛，并且会产生渗出，这种疼痛在早期在活动时会有酸痛，但是后期会产生粘连，会产生锐痛或刺痛。并且会在轻微的活动时疼痛就比较严重，而疼痛一旦严重又没有积极治疗，会严重地影响功能活动。肌腱在缺乏活动的情况下会肌肉萎缩。
第二，是旋转肌腱炎会产生多处肌腱和滑囊的渗出，并且会有炎症刺激，这些也会产生疼痛、粘连、肿胀，使活动受限，活动受限以后会影响局部的功能和肌肉的力量，从而产生肌肉萎缩的情况。
第三，是旋转肌腱炎，必然刺激周围的血管神经，也会对肌肉有影响，产生萎缩的情况。