任何一种手术都是有风险的，卵巢囊肿手术也是存在有风险的。只要是有创性的操作都是有危险的。卵巢囊肿手术的危险性和囊肿的大小以及患者的年龄大小，以及患者是否有基础性的疾病是有一定的相关性的。
如果患者比较年轻，并且囊肿比较小，卵巢囊肿手术的危险性就小一些。如果囊肿比较大，患者年龄也比较小，这种手术风险就会大一些。如果患者是老年人，并且有一些基础性的疾病，比如高血压、糖尿病，就会进一步增加卵巢囊肿手术的危险性。
具体卵巢囊肿手术的危险性的大小，需要根据患者的病情来进一步评定，不能一概而论。