梅克尔憩室会引起肠梗阻。梅克尔憩室的形态和卵黄管参与退化的程度有关，在发育过程中卵黄管没有完全闭合，之后和回肠相通，就会形成回肠远端憩室，也就是梅克尔憩室。
另外，以下4种情况都会让梅克尔憩室引起肠梗阻，表现症状为腹部疼痛、腹胀、呕吐以及恶心等。
1.当憩室开始向回肠内部翻转时，形成肠套叠。
2.以脐带为中心开始旋转，之后发生小肠扭转。
3.憩室嵌顿在疝囊中。
4.憩室内的纤维带和腹壁内的脏器，或者是腹壁出现黏连，从而导致小肠受到压迫。
需要注意的是，梅克尔憩室除了会引起肠梗阻以外，还会导致憩室出血、憩室穿孔、憩室炎等。