直肠脱垂有可能会导致直肠损坏。直肠脱垂的患者反复地脱出会造成患者直肠黏膜非常松弛，使直肠收缩力下降，直肠反复脱出会导致患者直肠黏膜受损，出现感染症状，导致糜烂、溃疡等。
有些直肠脱垂的患者脱出后出现嵌顿，会导致脱出的直肠迅速出现充血、水肿。严重的会因为缺血而引发脱出的直肠出现坏死。
直肠反复脱出也会导致直肠下端的排便感觉受损，从而引发患者出现感觉性肛门失禁。直肠脱垂也会牵拉盆腔内的神经，导致盆腔的神经牵拉受损，从而引发一些直肠症状。