早期结肠炎症状主要表现在腹泻、腹痛和其他相关症状。
早期患者腹泻程度较轻，大便次术增加，可达到每日排便2-3次，可伴有便血，可有轻度里急后重。但大便培养无致病菌，若同时伴有感染，可出现脓液。早期腹痛较轻，多为隐痛，多为左下腹部或仅仅为下腹部的不适，腹部触诊可无阳性体征。可伴有间歇性低热，可有体重下降等，青春期患者可有生长发育迟缓。
部分患者进食后还会出现腹胀，甚至少数患者会出现恶心、呕吐等症状，但出现以上症状不一定为结肠炎。