难治性癫痫临床上应做血常规、生化常规，包括肝功、肾功等检查。还有抗癫痫药的血药浓度测定，反复复查脑电图或者是射频脑电图。
还有头部的核磁共振检查，包括高分辨率的薄层磁共振检检查。还有常规的PET检查，可定位癫痫发生过程中对脑功能区域的影响。
难治性癫痫就则是癫痫的诊断明确，经过系统正规的积极治疗，应用两种以上抗癫痫药物，并且疗程足够。但是仍然不能控制癫痫发作的癫痫病，积极完善以上检查之后，考虑能否给予手术治疗。