多骨纤维发育不良需要根据病情进展选择治疗方式，一般病情较轻，或者无明显畸形的患者可采取内科治疗，降钙素对骨畸形造成的局限肿胀，和骨折刺激神经末梢引起的疼痛有明显止痛作用，无明显副作用，但价格较为昂贵，患者可根据自己的经济情况以及病情酌情选用。
二磷酸盐制剂可明显降低患者自发性骨折发生率，在治疗2～3疗程后骨痛及步态异常消失，肢体长度无变化，但尚未得到骨受损治愈的放射学及闪烁照相的证实，对于多骨纤维发育不良的肢体畸形严重者可行截骨矫形术。