多系统器官功能衰竭也称为多脏器衰竭，是发病在24小时以上，有两个或两个以上的器官或系统发生功能衰竭。多系统器官功能衰竭，可并发代谢性酸中毒和高血糖，最后亦可并发肝性脑病和昏迷。
多系统器官功能衰竭的防治原则是尽快液体复苏，防治感染、补足能量与营养应用保护脏器的药物。
由于感染持续炎症状态供养和组织灌注不足，是发生多系统器官功能衰竭，最常见和最重要的危机因素。
应先予以控制和针对处理，如纠正休克、及时处理原发病和外伤，清除坏死组织、引流脓肿、控制腹腔污染等，都是很重要的措施。不要滥用广谱抗生素，要注意保持肠腔内正常的细菌菌丛生态学。加强胃的正常杀菌作用，减少细菌及其毒素，进入全身。提供充分的能量和合成底物、支持共生厌氧菌、保持排便通畅，以减少结肠内细菌及其毒素。