导致肛周脓肿反复发作的原因有以下几个：
第一，是患者肛周脓肿没有经手术治疗，而由于肛周脓肿有内口，内口处会持续不断地感染，从而引发肛周脓肿反复发作。其次，是肛周脓肿自行破溃后发展成为了肛瘘，而肛瘘也会出现反复的感染导致反复发作。
第二，是经手术治疗的肛周脓肿患者，如果在手术过程中遗漏了脓肿的探查就会导致反复发作。如果患者单纯行肛周脓肿切开引流术，术后会发展成为肛瘘，也会导致反复发作。
第三，是经肛周脓肿一次性根治术的患者，由于手术时没有准确地找到肛周脓肿的内口，而遗漏内口的处理也会导致术后反复发作。