特发性癫痫综合征系目前诊断技术尚找不到明确病因的癫痫，这并不意味着没有原因，仅仅是尚未找到病因。
大多数具有单基因遗传背景，确定致病基因及功能是探索癫痫综合征防治的基础。基因检测对诊断有一定意义，电生理检查也有一定的诊断价值。
神经影像学检查，包括头颅正侧位X线平片、头颅CT、头颅核磁共振检查有重要的鉴别诊断意义。单光子发射断层扫描可检出致痫灶间歇期血流量减少，发作期血流量增加。正电子发射断层扫描PET可发现复杂部分性发作致痫灶，间歇期葡萄糖代谢减低，发作期代谢增加。