阵发性房颤的处理除了要对因治疗外，还需要控制心室率、转复窦律和预防再次发生。
首先，控制心室率。当发作时心率不快并且没有其他症状的患者，可以不给予治疗，但是要密切观察。
其次，如果心率异常增快，严重影响了心脏的功能，需要给予β受体阻滞剂、维拉帕米或者洋地黄制剂，减缓心室率，然后进行转复窦律。可以选择同步电复律或者使用胺碘酮、奎尼丁等药物转复。及时地转复窦律可以恢复心室的充盈量，从而改善心脏功能，也能够预防血栓形成。
最后，阵发性房颤患者还需要长期服用奎尼丁、普罗帕酮、胺碘酮等药物，减小复发几率。