引起新生儿乙型肝炎的主要原因是由于新生儿被乙型肝炎病毒所感染而引起的，而引起新生儿感染乙型肝炎的主要途径是通过母婴传播。
主要是母亲是乙型肝炎患者，当宝宝还在子宫内的时候，病毒会通过胎盘传染给胎儿；也可以在分娩的时候母亲的血液不小心渗入到胎儿血中或者吞咽了被病毒污染的羊水而传染。还可能是出生后密切接触乙肝病毒携带者或者通过吸入母亲的唾液、吃母乳等途径而传染。
因此，为了有效预防新生儿乙型肝炎的发生，需要积极阻断母婴传播。