雷公藤具有抗炎和免疫抑制作用，可用于治疗自身免疫性疾病。雷公藤的副作用较大，但现在人为提取做成的雷公藤多苷片，使其副作用减少了不少。它的副作用和不良反应有消化系统表现如口干、恶心、呕吐了、乏力、食欲不振、腹胀、腹泻、黄疸转氨酶升高，严重者可出现急性中毒性肝损伤、胃出血；血液系统可见白细胞、血小板下降。严重者可出现粒细胞缺乏和全血细胞减少。个别会有肾功能异常等肾脏损害；心悸、胸闷、心律失常、血压升高或下降、心电图异常、月经紊乱、月经量少或闭经、男子精子数量减少、活力下降；头昏头晕、嗜睡、失眠、神经炎、复视、皮疹、瘙痒等等。