龟头发黑一般和个人体质有关，例如色素沉着较多的人群，龟头颜色是比较黑的，这时身体其他部位皮肤也是比较黑的。
另外，当龟头患有疾病后，比如龟头囊肿、龟头炎，引起了龟头血液循环不良淤血，就会导致龟头颜色发黑。另外，患有阴茎疾病后，比如阴茎硬结症或者阴茎静脉曲张，会引起阴茎皮下淤血，这时就会导致龟头颜色发黑。
其次，体内雄性激素分泌过多时，性激素会刺激龟头，这时也会引起龟头颜色发黑。所以建议做龟头分泌物检查和龟头超声检查，排除患有这些疾病的可能性。