引起肠瘘的疾病比较多，在临床上常见的有以下一些：
第一，腹腔感染，一些腹部污染手术，由于术中操作不规范或者术中冲洗不彻底，而导致术后腹腔感染，从而引发肠瘘。
第二，吻合口瘘，肠道手术的患者需要行肠道吻合术，因为各种原因而导致吻合口愈合不良出现吻合口瘘，也会引发肠瘘。
第三，肠道炎症性疾病，常见的为克罗恩病，克罗病由于病变波及肠壁全层，会引发肠壁穿孔而导致肠瘘。
第四，肠道憩室，当肠道憩室有感染时，就有可能会导致穿孔。
第五，阑尾炎，急性阑尾炎有可能会穿孔而引发肠瘘；另外还有可能是肠道恶性肿瘤、肠道外伤、肠道结核感染等等原因。