腹膜后脓肿除了内科的抗生素治疗外，病情严重的患者可选择外科手术治疗，首选治疗方法手术引流。
术中应尽量避免经腹腔引流，防止脓肿扩散，造成腹腔内的广泛炎症。腹膜后脓肿引流手术有时需根据原发病灶情况而附加其他手术，如阑尾切除、肾切除术、肠切除术、肠造瘘术等。
术后需加强营养支持治疗，改善患者的营养状况，有助于提高组织愈合能力和机体免疫力，促进感染的控制和局限，加快组织的修补。术后需要注意引流量，避免引流管的梗阻等一些情况。