肺部真菌感染应该注意以下几点：
首先，要注意早期及时地诊断肺部真菌感染以及感染的真菌种类，因肺部真菌感染的种类较多，此时其抗真菌的药物和疗程也有一定的不同；故对于有肺部真菌感染的患者，要早期行病原学的诊断。
其次，要注意抗真菌的药物选择，根据不同种类的真菌选择其相应的、敏感的抗真菌药物治疗，同时加强对症处理。
另外，要注意肺部真菌感染的抗感染疗程通常较长，多需要6~8周或更长的时间。还要注意在抗感染的同时还要改善患者机体免疫力，特别是有基础疾病、免疫力低下的患者，要增强其抵抗力、治疗其原发基础疾病，避免其肺部真菌感染的复发。