治疗肺气肿的药物有很多种，但其主要治疗用药是支气管扩张剂，例如患者多需要使用长效支管扩张剂的规范治疗，改善其临床症状。临床上，常使用噻托溴铵粉吸入剂、布地奈德福莫特罗粉吸入剂、沙美特罗替卡松粉吸入剂、茚达特罗格隆溴铵吸入粉雾剂等。
通常还有短效支气管扩张剂，例如沙丁胺醇气雾剂、异丙托溴铵气雾剂。必要时还可联合茶碱类药物，例如多索茶碱、茶碱缓释片等，起到解痉平喘的作用。
在肺气肿急性加重时，多需要使用短程的静脉或口服糖皮质激素治疗。肺气肿的治疗用药，还包括抗感染、止咳、祛痰等药物，对症处理。部分患者，还可以联合雾化吸入的药物治疗。