滋养细胞肿瘤临床上为了分辨其良恶性，主要从以下三个方面：
一、从肿瘤的生物学行为和临床表现方面。恶性滋养细胞肿瘤具有转移性，临床上除了阴道流血、子宫增大外，还可以出现转移灶的症状。例如头痛、呕吐、肝区疼痛、腹痛、咳嗽、呼吸困难等。
二、两者还可以通过血液学检查进行鉴别。一般恶性滋养细胞肿瘤的血液学检查可以看到人绒毛促性腺激素的数值明显的高于正常。
三、两者的鉴别还可以从组织病理学方面，这是鉴别良恶性肿瘤的最为重要的一种鉴别方法，也是最根本的方法。