萎缩性咽炎经过积极的针对病因，和对症的治疗是可以治愈。
萎缩性咽炎在治疗之前也要注意排外有无全身性的疾病，导致咽喉局部呈现萎缩性咽炎的表现。对于原有的基础疾病要积极的予以相应治疗。其次患者也应该保持良好的生活习惯，戒烟、戒酒，避免辛辣、刺激的食物等，部分患者经过上述的对症处理，患者的临床症状是可改善。
但对于症状比较严重的患者需要予以相应的药物治疗，例如患者应该保持口咽部的清洁湿润，必要时还可以予以雾化吸入等治疗，补充一些复合维生素以及铁剂、锌剂等，有时还可以予以碘甘油涂抹咽喉部，部分患者还可以联合中医中药的对症处理。通过上述的综合治疗，萎缩性咽炎多能治愈，但要注意其容易复发。