小阴茎是指阴茎生长长度小于相同年龄或相同性发育正常状态人群的阴茎长度平均值2.5个标准差以上者，但解剖结构和外观形态看是正常的。引起小阴茎的主要原因有如下几个方面:
一、低促性腺激素性腺功能低下症，主要包括脑组织结构异常和无脑组织结构异常的先天性促性腺激素释放激素缺乏。
二、高促性腺激素性腺功能低下症，包括病变原发于睾丸的原发性性腺发育不全，促性腺激素受体缺陷，雄激素合成或者代谢障碍。这类患者的下丘脑垂体分泌功能均正常，引起小阴茎的原因主要在睾丸本身。
三、原发性小阴茎。目前病因未明确，但青春期后发育可基本正常。谢谢。