喉气囊肿在治疗期间，如果需要服用药物，通常选用抗生素类型的药物比较好。
因为单纯性的喉气囊肿通常是不需要使用药物来治疗。如果需要使用到药物，往往是因为喉气囊肿伴发了炎症感染的情况出现。此类情况下，患者可以根据自身的体质，选用相对应的抗生素类型的药物来治疗。
对于青霉素没有过敏现象的患者，可选用阿莫西林等青霉素类的药物来治疗。但对于青霉素存在过敏体质的患者，可以选用美洛西林、头孢唑林等抗生素类型的药物来进行相对应的抗炎治疗。