眼眶囊肿有多种，包括皮样囊肿、粘液囊肿、畸胎瘤、单纯性囊肿、血囊肿、溢脂性囊肿，先天性小眼球合并眼眶囊肿等等。
皮样囊肿，进展缓慢，甚至有禁止期，如不影响功能和外观，可以随诊观察。如果需要治疗，主要是手术切除囊壁和囊腔要彻底去除，以免复发。如果是畸胎瘤，早期需要手术切除，如遗留囊壁将引起复发，并可导致恶变。
如果是粘液囊肿可以和五官科医生合作手术切除囊肿，鼻道开窗，按鼻窦引流或刮除粘膜，窦腔填以明胶海绵海，最后纤维化，使粘液自行引流。