巨细胞病毒和EB病毒两者不完全一样，有相同点，但也有不同点。相同点是：
1.两者都是疱疹类病毒，都属于DNA病毒。
2.大多数人都隐性感染过，查IgG抗体阳性。
3.无论隐性感染还是显性感染，感染之后病毒都不能够从体内彻底清除掉，而是长期潜伏在淋巴细胞内，将来免疫功能低下时，可以被再次激活引起感染。
4.急性感染时两者都可以引起发热、多发淋巴结肿大、肝损害，查血白细胞总数升高、淋巴比例升高，可以出现异型淋巴细胞。
5.两者被激活后都可以引起全身各系统的感染。
两者的区别点是：
1.前者可以通过尿液、阴道分泌物、精液、唾液、乳汁感染，后者主要通过唾液直接接触感染。
2.前者健康人急性感染，没有咽峡炎，即双侧扁桃体没有肿大化脓表现，而后者有咽峡炎。
3.前者可能与动脉粥样硬化、冠心病有关，不除外有潜在的致癌性，而后者与鼻咽癌、淋巴瘤、嗜血细胞综合征有关。
4.前者应用更昔洛韦治疗效果比较好，后者如果是慢性的活动性感染，没有有效的抗病毒药物治疗。
5.前者器官移植者、骨髓干细胞移植者、HIV感染者感染几率比较高，而后者感染几率不高。