新生儿肠扭转一般主要是因为先天的发育因素导致的，发育的时候肠旋转不良，就容易出现新生儿肠扭转。新生儿肠扭转好发部位，主要是小肠、结肠回盲部以及乙状结肠。
对于小肠肠扭转，如果症状不严重，可以进行观察。随着小儿生长发育有可能会好转，如果症状非常严重需要手术治疗。
如果是结肠的回盲部或者是乙状结肠扭转，可以使用气钡灌肠或者是水灌肠进行复位。如果保守治疗效果不好，需要手术给予复位并固定，防止再次扭转。