附睾囊肿3mm不算大，一般不会引起不适症状，也不会影响到睾丸的生精功能，通常不需要进行特殊治疗，应定期去医院进行复查，每6个月复查一次，观察囊肿是否有增大的迹象。
如果囊肿持续增大，导致附睾部位出现严重，疼痛和肿胀等症状，并且严重影响到了男性的性生活及生育能力，应该能种进行切除，在术后大多数患者预后良好。
在治疗期间，患者应多注意休息，不要做剧烈运动，如果附睾部位下坠感比较明显，可使用阴囊托将阴囊托起。