甲胎蛋白增高的原因，主要有各种类型的慢性肝炎、肝硬化、肝癌、生殖系统肿瘤和特殊生理时期。
甲胎蛋白属于一种糖蛋白，主要由干细胞和卵黄囊合成，当肝细胞受到损伤的时候，血清中的甲胎蛋白具有增高表现，常见的疾病有各种病毒感染的肝炎、肝硬化或者肝癌等。
胎儿肝细胞没有发育完全的时候，可以分泌较多的甲胎蛋白，甲胎蛋白可以通过脐带进入孕妇体内，因此妊娠期间的女性甲胎蛋白也有增高的表现。生殖系统的肿瘤也可以导致甲胎蛋白增高，如卵巢癌和睾丸癌等也会引起甲胎蛋白增高。