扁桃体炎发病期间，一般建议尽量避免受孕。患者扁桃体炎发病期间，有可能会导致人体内环境紊乱，从而可能会影响精子或者卵子的发育，虽然影响较小，但不能完全排除。
另外，如果扁桃体炎是由于病毒感染导致的，不排除会增加新生儿的畸形率。所以，建议患者最好等到扁桃体炎完全治愈，身体健康的状态下再备孕较为稳妥。
另外，扁桃体炎发病期间如果备孕，很多药物不建议使用，也不利于扁桃体炎的治疗。至于扁桃体炎期间备孕对于胎儿发育具体的影响几率，现在没有临床资料，患者如果受孕需要根据孕检结果，咨询主治医生的建议。