基底凹陷症又称为颅底凹陷症，多为先天畸形，少部分是因骨病等其它原因而导致。该病是因颅底的枕骨大孔区的颅骨向上陷入颅腔，环椎前移，齿状突向前向上进入枕骨大孔，而压迫延髓及颈部神经，出现相应的症状。
颅底凹陷症主要分为，前变化型和中线旁陷入型。临床表现为颅底凹陷症，常在青年期开始起病，随着年龄的增长，在中年以后会逐渐出现相应的神经功能障碍症状，如眼球震颤、共济失调、眩晕、躯体运动感觉障碍等。
病情严重的患者，可出现呼吸抑制及睡眠性呼吸困难等。该病主要是通过手术等外科治疗的方式，来纠正颅骨的畸形。