一年四季都可发生心源性脑血栓，尤其在秋冬季节交替的时候，最易出现本病。
因为本病的发生和患者存在心源性血栓有密切关系，而心源性血栓主要见于心房颤动，心房纤颤时患者心房内会有附壁血栓形成，这时候血栓如果出现脱落，进入血液循环，会经颈总动脉进入大脑动脉，并阻塞大脑小动脉，而形成脑血栓。
秋冬季节气候变冷，全身血管收缩紧张，这时候就容易促进房颤的发生，以及心房内血栓的脱落，所以在这个季节尤其要注意防范本病的发生。