先天性膝关节畸形矫正手术风险较低，主要包括麻醉风险以及手术的风险。因为在麻醉时可能会引起心脑血管意外，以及药物过敏等情况，但此种概率较低。
在手术过程当中，如果操作不当，还会造成血管或神经的损伤，从而引起一些后遗症。在手术以后，如果没有做好手术切口部位的护理，还有可能会导致感染，感染如果累及到了骨骼部位，还会引起骨髓炎，但这些风险，大多都是在可控的范围内，风险较低。
在手术以后也需要加强护理，合理膳食，多注意休息，有助于促进身体的康复。