吃了幽门螺旋菌的药胃不舒服，可能是药物副作用或者过敏等原因引起的。
1.药物副作用。治疗幽门螺杆菌的药物一般包括抗生素和保护胃部的药物，部分患者服用药物后可能会出现药物对肠胃造成刺激的情况，容易存在胃不舒服的表现。
2.过敏。小部分患者对治疗幽门螺杆菌药物存在过敏反应，也会出现胃不舒服以及皮肤长红疹等多种情况，严重时还可能出现过敏性休克。
患者应及时停止用药，并去医院咨询医生，明确引起上述情况的具体原因，而不能继续用药。