羊痘病毒和口蹄疫的区别，在于发病的原因以及皮肤表面的症状。
这些羊痘和口蹄疫虽然都是病毒感染，但是羊痘是由于羊痘病毒感染，而口蹄疫则是口蹄疫病毒感染，感染的病毒种类不一样。
而从临床症状角度考虑，羊痘主要会在皮肤表面形成一些结节、丘疹，丘疹表面会形成一些明显的结痂，后期可能会形成局部组织的乳头状增生。而口蹄疫则主要会以全身症状为前驱表现，出现发热、头痛、乏力，后期症状加重，会出现明显的寒战、恶心、呕吐。然后才会在皮肤表面出现典型的症状，主要以手、脚等部位出现一些小水疱，伴随着瘙痒为主。