隐斜形成的原因有多种。例如内隐斜可能存在肌肉、节制韧带、肌鞘、肌间膜以及肌肉附着点的解剖因素异常。也可能是调节因素，有远视眼的患者过度使用调节，可以诱发过强的辐辏功能。还有可能是神经因素，辐辏中枢过强的兴奋导致内隐斜。
外隐斜则可能是外直肌较厚或外直肌节制韧带的过强，也可能是未矫正的近视，因看近不用调节，使辐辏失效而引起外隐斜，或者辐辏兴奋不足导致外隐斜。
上隐斜病因主要是神经因素，也就是神经肌肉轻度麻痹所导致，垂直肌肉解剖异常，一眼或双眼的内外直肌附着点比较高。