肛门指检是肛肠科最常规，也是最基础的一个检查。
每个肛肠科的患者都会行常规肛门指检，做一个初步的检查，以排除直肠下段以及肛门周围的一些疾病。
肛门指检并不能代替结肠镜的检查，因为肛门指检是医生通过手指进入患者的肛门进行检查，其检查的距离仅仅限于距离肛缘5公分之内的下端直肠以及肛管。而对于怀疑上段的结肠有问题的患者还是应该行结肠镜的检查。两个检查是起到相辅相成的作用。