肛裂的检查非常简单，一般在肛肠科门诊就可以完成，主要的检查为医生进行的肛门视诊以及肛门直诊。
肛门视诊时，医生需要观察肛门周围有无异常的赘生物，比如肛裂所导致的哨兵痔，还有肛裂裂口的位置、大小、裂口周围的组织是否有纤维化。
还有肛门指诊，一般情况下肛裂患者不建议肛门指诊，因为检查的过程中会导致患者产生剧烈的疼痛，但如果肛门内有肿物突出的，比如有肛乳头瘤，必要时需要做肛门指诊。肛门指诊以前应充分润滑肛门，减少局部的刺激以及疼痛感。
另外，还包括内镜的检查，比如对于肛裂便血原因有怀疑的，应行内镜检查，排除肠道内的出血。