由于肛裂的症状非常典型，根据典型的排便时以及便后疼痛伴有便血的临床症状，诊断并不困难。
体格检查时，大多数肛裂可以通过向两侧牵开同步诊断，可以看到局部的皮赘，以及慢性溃疡的裂口，基本就能确诊。
肛裂一般不做肛门指诊，因为做肛门指诊会引起患者产生剧痛。但如果有必要的情况下，可以考虑在麻醉下进行肛门指诊，比如局部可以使用利多卡因凝胶后，或者用较细的手指和乙状结肠镜进行肛门下段直肠的检查。