单眼双上转肌麻痹在第一眼位时垂直斜视度较大，可伴有同侧眼的拮抗肌和对侧眼的配偶肌功能过强。因此手术以减弱拮抗肌或者配偶肌矫正垂直斜度为主。健眼注视时，则减弱患者的下直肌和上斜肌。
如患眼为注视眼，可以考虑减弱健眼的上直肌和下斜肌，这样可以照顾正前方和下方注视野不出现复视。第一次手术后观察半年，如果仍残留垂直斜视，则第二次行患眼上直肌截除或健眼的下斜肌切除。
如患眼已做两条直肌仍残留外斜视，则行健眼外直肌后徙，内直肌截除术。