遗传代谢病有可能会引起脑炎。遗传代谢病是指维持机体正常代谢，所需的某些特殊的物质的基因，发生突变而引起的疾病。遗传代谢病会引起神经系统异常和代谢异常，从而可能会诱发颅内感染性疾病，包括细菌感染、病毒感染、隐球菌感染、结核分枝杆菌感染等。
本病发病的时候会伴有尿液的气味异常，还会伴有低血糖、高氨血症。严重的患者会出现肝脏衰竭，表现为惊厥、嗜睡、昏睡、昏迷，病情严重的患者会死亡。
当本病发作时，没有特效的治疗方式，主要以预防为主。